
中国新闻服务局,西安,4月18日(记者阿丽娜),记者从第18届智能网络和网络安全学院实验室,《电信部》中发表的第18届智能网络和网络安全学校实验室中学到了。这项研究促进了马铃薯基因组研究的理论和技术创新,这是欧洲四倍体人群遗传差异的85%,并为智能和全球粮食安全提供了OMIC的主要来源。
马铃薯起源,家庭和早期儿童的一般方向。西安·乔港大学提供的图片
据了解,马铃薯起源于南美的安第斯山脉高地,大约在10,000年前被驯化。它是由西班牙水手在第16届Si Siglo的欧洲介绍的,然后传播到世界,这已经成为块茎最重要的收益率。目前,全世界有超过13亿人吃土豆作为StAple饮食和中国已成为世界上最大的制造商,其年产量近1亿吨。选择和繁殖好土豆对于确保中国甚至全球的粮食安全具有重要意义。
但是,商业马铃薯通常是同源的四倍体:简而言之,每个细胞基因组的染色体续集都具有与双胞胎相似的四个副本(A1/A2/A3/A4)。由于每个采用的认可和积累,因此副本的副本(即基因组重建)始终是科学界的全球挑战,因此了解四倍体土豆的遗传信息仍然存在很大的空间。最近,成功的学家通过构建遗传图来识别单个类型的基因组,但相当于获得难题的一些碎片,并且在四倍体马铃薯种群水平的遗传差异仍然不清楚。 Geno的复杂结构我的组织和缺乏理论知识使混合选择具有挑战性。
为了研究四倍体马铃薯种群的遗传多样性,其繁殖史是可追溯的,并为数字育种提供了基本的科学分子水平,科学研究小组已经启动了泛基因组研究。
研究团队是由同源的四倍体基因组重建方法-TetradeCoder设计的创新,该方法解决了挑战挑战。 ISOR消除了对遗传图的希望,并降低了以下技术的阈值。它仅根据基因组参考,三代片段的全基因组顺序技术以及捕获染色体符合的技术来构建接触地图。朋友的聚类算法用于实现基因组键入。实验测试已经确认其打字的准确性超过98%。
一种重建同源多倍体基因组-TetradeCoder的新方法。图片p西安·乔孔大学(Xi'an Jiotong University)
研究小组筛选了10个四倍体土豆(起源于1810年至1932年),并重建了40组高质量的单倍型基因组。马铃薯线分析表明,历史类型是欧洲土豆史上的主要材料,广泛用于混合选择和现代品种。它们代表了欧洲文化土豆遗传的差异,可以为检查现代类型的遗传潜力提供必不可少的东西。
科学研究组建立了四倍体马铃薯泛基因组解决的第一种单倍型,解码了人群遗传变异的85%。评估发现:(1)以下 - 遵循基因组的单倍型的差异非常重要(约2%)。该小组认为,这种现象与野生种质的大规模浸润有关。差异 - 序列各不相同,为土豆的遗传基础适合环境并增加分子生物学研究的复杂性。 (2)基因组中特定单倍型的数量受到限制。在40组单倍型基因组中,在任何10 kB窗口中只有9个特定的单倍型。这种现象就像一个厨房炉子里装满了瓶子,但它是糖或盐,味道受到限制。该小组认为,这来自土豆在环境的护理,分娩和适应过程中经历的许多遗传瓶颈。 “超高杂合化 +有限的单倍型”的遗传多样性的特征教授了现代马铃薯育种的方向:追求产量和质量,同时引起人们的注意(例如引入外源性Gen或使用基因组编辑和其他技术),以改善对疼痛,抵抗压力的抵抗力,抵抗压力和捕获压力的抵抗力。在环境中。
基于单倍型图的基因分型的新方法。西安·乔港大学提供的图片
回复RCH团队还提出了一种基于单倍型图的新基因型方法,这可以解决更好和经济上的分类问题。单倍型仅限于历史类型的马铃薯的基因组,而马铃薯是通过块茎传播的,并且基因组的重组最少,这意味着现代类型的基因组中有高度储蓄的片段。结合了 - 包括这一科学发现,单倍型图是使用TetradeCoder回顾的40组历史单倍型Gens构建的,并将其用于生成参考系统。通过简短的阅读阅读对齐图算法和算法优化的顺序和设计,现代类型的单倍型基因可以重建和经济。新方法的有效性已通过诸如“ Russet Burbank”(1908年的原始)类型的示例证明,该类型仍用于当今的薯条,仅占tetradecoder方法的5%。
上述研究受到基本技术的损害同源多倍体基因组分类的含量瓶颈,单倍型图分类的方法可将评估成本降低95%;它已经建立了全球四倍体马铃薯泛基因组的全球测试,该测试系统地描述了蓝图的遗传变异,反映了“超高杂合 +有限的单倍型”的遗传多样性,增强了基因组理论,并征服了该领域的研究领域。结果不仅给NG提供了对马铃薯基因组研究的新观点,而且还为其现代诞生提供了重要的方向。 (超过)
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